Mã đề tài:	DHH2020-04-122
Tên đề tài:	Xây dựng quy trình định danh loài vi khuẩn gây bệnh bằng kỹ thuật giải trình tự đoạn 16S rRNA
Cấp đề tài:	Đề tài cấp Đại học Huế
Đơn vị chủ trì:	Cơ quan Đại học Huế
Đơn vị thực hiện:	Trường Đại học Y dược
Loại hình đề tài:	Cơ bản
Lĩnh vực:	Vi sinh vật học y học
Mục tiêu đề tài:	Định danh mức độ loài các chủng vi khuẩn gây bệnh được phân lập từ bệnh phẩm bằng giải trình tự mã hoá 16S rRNA
Nội dung đề tài:
Kết quả đề tài:	- 90 chủng vi khuẩn được phân lập từ bệnh phẩm bằng các phương pháp thông thường đang thực hiện tại Khoa Vi sinh, BV Trường đại học Y Dược Huế. - Khảo sát khả năng ứng dụng phổ rộng của cặp primer phổ quát trong quy trình khuếch đại đoạn 16S rRNA của vi khuẩn: 27F và 1492R. Primer hoạt động tốt trong quy trình khuếch đại đoạn 16S rRNA, sản phẩm PCR là đoạn gen mã hoá 16S rRNA dài xấp xỉ 1500bp. - Khảo sát quá trình tách chiết DNA, tinh sạch sản phẩm PCR, quy trình giải trình tự gen mã hoá 16S rRNA. Nghiên cứu cho thấy: quy trình tách chiết theo phương pháp “boiling” có thể đạt hiệu quả tương đương các kít tách chiết như Phenol/Chloroform. Quy trình tinh sạch sản phẩm PCR trước giải trình tự là cần thiết để đảm bảo sự chính xác, đầy đủ của dữ liệu giải trình tự, cho phép thu được độ dài hơn 1000bp trên mỗi mạch. - Định danh mức độ loài 100 chủng vi khuẩn bằng phương pháp giải trình tự đoạn 16S rRNA. Trong đó, có 12 chủng có kết quả khác biệt với kết quả định danh theo phương pháp truyền thống. Các trình tự gen của các chủng vi khuẩn định danh được đăng lên CSDL sinh vật nhân sơ (16S ribosomal RNA) của NCBI. - Hoàn thiện quy trình kỹ thuật thực hiện định danh loài bằng giải trình tự 16S rRNA. Nghiên cứu cho thấy hoàn toàn có thể ứng dụng kỹ thuật này tại các cơ sở y tế trong việc định danh các vi khuẩn đến mức độ loài nhằm giảm thời thực hiện quy trình định danh, tăng độ chính xác của kết quả định danh mức độ loài.
Năm bắt đầu:	2023-07-17
Năm kết thúc:	2023-07-17
Xếp loại:	Tốt
Tình trạng:	Đã hoàn thành
Phân loại sản phẩm:	Quy trình công nghệ
Địa chỉ ứng dụng:	Bộ môn Vi Sinh, Trường ĐH Y-Dược, Đại học Huế Khoa Vi Sinh, BV Trường Đại học Y-Dược Huế
Bài báo liên quan:	1
Kinh phí đề tài:
Người tham gia:	Nguyễn Hoàng Bách (Chủ nhiệm)